ซานโตสกลับมาลงเล่นในรายการอินเตอร์คอนติเนนตัลคัพ

ซานโตสกลับมาลงเล่นในรายการอินเตอร์คอนติเนนตัลคัพในปีถัดมาโดยรักษาแชมป์โคปาลิเบร์ตาดอเรสไว้ได้ โดยคราวนี้ต้องพบกับเอซี มิลานของเนเรโอ รอคโค หลังจากที่พวกเขากลายเป็นแชมป์ยุโรปเป็นครั้งแรก เปเล่เล่นแค่เลกแรก เขายิงสองครั้งในซานซีโร ทีมปีศาจแดง

ในปี 1969 เปเล่กลับมาที่มิลานเพื่อแข่งขันในทัวร์นาเมนต์ใหม่แต่มีอายุสั้นที่เรียกว่า Intercontinental Super Cup อินเตอร์เป็นคู่แข่งกันหลังผ่านเข้ารอบสำหรับแชมป์ยูโรเปี้ยน คัพ